Illumina免费提供新冠病毒的数据分析工具

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Illumina公司宣布推出新型冠状病毒的数据分析工具 - Illumina SARS-CoV-2数据工具包（Illumina SARS-CoV-2 Data Toolkit）。这是一套新的数据分析工具，适用于利用新一代测序（NGS）来研究新冠病毒的研究人员。

据介绍，这款工具能让研究人员更容易地检测和鉴定样本中的SARS-CoV-2病毒序列，并将其发现提交到重要的公共数据库。值得一提的是，Illumina正在向全球科研群体免费提供该工具包，为抗击这次新冠病毒大流行提供支持。

该工具包与Illumina在全球投入使用的15,000台测序系统相结合，能够帮助全球的研究人员和公共卫生人员追踪疫情的路径，了解传播途径，确定病毒进化的速度以及病毒当下的变化是否会影响治疗效果。Illumina全球技术平台的这种连通性将让研究人员和公共卫生人员以前所未有的方式共享信息。

Illumina的首席医疗官Phil Febbo博士表示：“NGS在抗击新冠病毒的战斗中处于第一线，我们很自豪能够提供这一技术来支持和帮助人们追踪传播，开展监测，开发疗法和疫苗，并确保长期的全球安全。通过专门的设计，这些工具可用于新冠病毒以外更为广泛的领域，从而使全球各国在未来能建立起一套主动监测疫情暴发的体系。”

Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包包含新的DRAGEN功能，让人们能够利用DRAGEN的速度和准确来加速传染病的监测。它包括用于传染病检测的DRAGEN RNA病原体检测应用程序、用于暴发监测的DRAGEN宏基因组学应用程序、SRA导入应用程序和GISAID共享应用程序。

这种全新的工具包与Illumina呼吸道病毒靶向富集工作流程兼容，能让研究人员直接将数据从所有Illumina测序仪安全地传输至BaseSpace Sequence Hub，并使用DRAGEN RNA病原体检测应用进行快速、全面的分析。分析完成后，研究人员可以直接从BaseSpace Sequence Hub将数据提交至全球流感共享数据库（GISAID）。在2020年10月之前，Illumina在BaseSpace Sequence Hub上免费提供新工具包。

希望提高其实验室效率的研究人员可以使用Clarity LIMS来追踪和监控COVID-19样本，从而提供全面的端到端解决方案。Illumina为所有使用Clarity LIMS进行新冠病毒检测的研究人员提供为期一年的免费许可证。为了通过BaseSpace简化端到端的新冠病毒样本追踪和工作流程管理，Clarity LIMS增加了两个针对RT-PCR和NGS的新工作流程。

Illumina SARS-CoV-2数据工具包仅供研究使用。对于寻求临床报告功能的人员，Illumina推荐使用IDbyDNA Explify平台，该平台现在已经通过BaseSpace Sequence Hub提供。