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中欧美新冠病毒数据开放平台汇总

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发表于 2020-4-28 08:57:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
上周,EMBL(欧洲分子生物学实验室)旗下的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)公布了COVID-19数据开放平台入口,平台包括广泛的数据类型,包括基因组,蛋白质和显微镜数据以及科学文献。

早些时候,美国NIH(国立卫生研究院)发布了新冠数据开放平台,包括来自联邦CDC等机构、NIH、公共财团和私人机构的数据。特别的,这个平台的承办方为2018年启动的"数据科学战略办公室",值得学习。

更早时候,中国科学院在国家微生物科学数据中心、国家基因组科学数据中心向全世界共享数据的基础上,搭建了“中国科学院新型冠状病毒肺炎科研文献共享平台”。

我国中科院新冠科研文献共享平台:
http://ncov.cas.cn
欧洲EBI新冠数据平台:
https://www.covid19dataportal.org
美国NIH的新冠数据平台:
https://datascience.nih.gov/covid-19-open-access-resources

【编者按】EBI的主任Birney也是全球基因组和健康联盟(GA4GH)负责人,该联盟2013年以来致力于为基因组及健康相关数据的共享制定标准和统一方法。Birney倡导将这些标准应用于COVID-19研究。我国国家基因库也是GA4GH的成员,其生命大数据平台(CNGBdb)链接为https://db.cngb.org。同时对比EBI和NIH的网站结构、数据广度和深度,我国尚缺乏对标的、公立的、公认的、广泛使用的基因组数据平台,这是生命健康转化应用的核心平台,从下往上的时间成本较高,需卫健委等部门从上往下的政策引导和投入。
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发表于 2020-5-19 11:26:34 | 显示全部楼层
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