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（tNGS在厂家的故事里，不在专家的眼里和心里）
上周末的长沙检验年会，刷屏了IVD人的朋友圈。时隔三年，春暖花开，检验行业的最大规模的会议终于重启。笔者是NGS从业人士，第一次参加检验年会，带着几个问题，前去一窥究竟。
（外行看热闹，本文内容纯属个人见解，欢迎大家指正和讨论）
检验行业无疑是IVD人的主场，各大厂家精致的全自动生化、发光、免疫一体机，壮观的流水线，在精心布置的特装展位上熠熠生辉，仿佛科幻片中的场景。相比之下，NGS设备相形见绌，自动化和智能化程度没有10年也有8年的差距，有点像是半成品。不禁期待一下，10年之后是否可以看到完成进化的NGS流水线呢？
但是不成熟，也往往意味着还有很大的发展空间嘛。都说IVD太卷，缺新品，NGS是否有机会成为年度“最佳新人”呢？而说到检验领域的NGS新技术，现在最热门的就是病原tNGS了，在今年的检验年会上，tNGS的身影在哪里？有没有爆款产品和亮眼的应用数据？用户的评价如何？
厂家卫星会
先看看厂家的展台和卫星会，本次年会上有tNGS/mNGS产品展示的主要有以下厂家。由于部分厂家卫星会时间冲突，没能全部去现场，欢迎补充：
1.金域
一年17万例，tNGS业内首席。
金域以第三方医检服务为主，tNGS项目菜单非常丰富，上感50、呼吸100、神经100、感染1000、TB-NTM等，分别针对不同症候群、不同标本类型、不同目标病原和不同的应用场景。可以在一定程度上解决mNGS价格贵、数据分析难、分辨率不够、样本处理难以兼顾所有病原、难以标准化的痛点。本次没有看到期待中的17万例tNGS真实世界大数据的分析和展示，继续保持悬念吧。
但金域是典型的医检服务商，在设备方面相对薄弱，虽然有金圻睿的km miniseq测序仪在手，但似乎没看到有测序和自动化设备相关的宣传内容。不过卫星会上金域的负责人也透露有自动化的下一步部署。
2.微远
微远是mNGS的资深玩家了。此次重磅发布了全自动样本制备系统VISIONauto 1000，可以一直做到文库定量和pooling，适配2种mNGS建库和3种扩增子建库，是目前看到的病原自动建库仪里功能最强大的。但没看到微远的tNGS产品。
在微远的菜单里看到了单分子测序产品，据说不是纳米孔平台，那会是哪家的呢？欢迎大家来八一下。
3.华大基因
mNGS的发源地之一。从硬件到软件，从测序到质谱产品一应俱全。值得一提的是华大目前只有mNGS，没有tNGS产品。对应tNGS功能的是基于PCR的多联检产品。
4.圣湘
华丽牵手真迈，圣湘完成了大拼图。感染产品最全，圣湘称第二别人不敢称第一。mNGS和tNGS项目主要是在旗下圣维尔开展医检服务。
5.金匙
华大系的mNGS资深企业，卫星会发布mNGS和tNGS本地化产品。由于时间冲突错过了，有去过的朋友欢迎分享精彩内容。
6.予果
和微远比较类似，tNGS产品阵列比较全面，主要是PACEseq、 Bloodseq、TB Pro、DRseq 4个产品。自动化模块中规中矩但该有的都有了：核酸提取仪、建库仪、测序仪（illumina国产化官配）、生信服务器（软件已获证）
7.微岩
mNGS产品，配套全流程自动化模块。没见到tNGS产品。
8.杰毅
杰毅的自动化建库仪NGSmaster比较特（另）色（类），4个独立卡盒，比起微远的VISIONauto 1000大衣柜，小巧了很多，只有一台打印机大小。但是只能做到文库纯化，后面的定量和pooling还是得自己来。另外有一个问题，建库仪的通量与适配的nextseq550的芯片通量似乎不太匹配，懂行的朋友可以说说这是啥设计？
厂家信息整体来看，病原NGS厂家还是更多地在宣传mNGS，tNGS还不是标配，甚至撑不起一个专场卫星会。不知道明年是否会有厂家做tNGS的专题卫星会呢？比如临床各学科+检验科的专家从多角度来展示tNGS的应用成果。另外已有tNGS产品也比较同质化，基本上是呼吸道、神经系统、血流感染、结核这几种。
从厂家的产品布局的角度来思考，可能tNGS尚无法撑起半边天。tNGS可能更多地是mNGS的补位角色，在用途和价格上填补从mNGS到PCR多联检之间的差位。对产品经理来说也是个大挑战，习惯了“一网打尽”式做NGS产品，现在需要精细化设计tNGS panel，要从患者群、医生习惯和需求、诊疗流程、使用场景、实验技术各个维度去反复论证，还要精细测算成本和价格，仿佛站到了抓娃娃机前，抓手落下前的每一刻都充满了不确定性。
另外各厂家适配的二代测序仪除了华大、金匙用MGI，圣湘用真迈，其它厂家还是illumina为主，测序生态圈的建立非一朝之功。
专家讲座
再看看主会场重量级专家的讲课内容。有点意外，本次并没有tNGS的主题会，只有半天的mNGS主题会，大专家的观点和top医院的实践往往是行业风向标，让我们来看看专家的重要观点。
1.华西医院精准中心
本地化实践分享。13人团队，3种测序平台，多学科MDT模式审核报告，已完成超过6000例mNGS检测。报告的解读是重难点，需要多学科结合病人情况具体分析。
2.复旦大学附属中山医院感染病科
分享了一些疑难病例。中心思想是：mNGS的结果解读，太难太难了。
3.浙大附属第一医院
本院mNGS病例和数据分享。mNGS解释不了所有的复杂感染，阳性可以使用，阴性需要谨慎。对分子检验技术要求很高，需要组建检验-技术-微生物-临床多学科团队，最终确保结果的可靠性。
这几家医院应该算是国内做病原NGS最有经验的单位了。专家们一致认可mNGS是非常实用很有潜力的病原检测新技术，也是临床的硬需求，可以很好地补充传统的病原微生物检验手段的不足。
从IVD化和本地化程度来看，这些top级医院，大概最多算把第三方医检所的mNGS实验室，连机器带人（职能上）搬到了自己的检验科，见贤思齐一下发光的“样本进报告出”全自动流水线，还有很远的距离。样本如何处理，要不要液化要不要破壁？要不要去宿主？要不要做环境质控？报告怎么看？需要多学科MDT？太多的环节缺乏标准化，需要人工处理。Top医院都是疑难重重，再下层的医院就更不可能实现mNGS本地化了。
相比之下，目的明确、意义明晰、流程方法更标准化的tNGS看起来是个更好的解决方案，但为什么会上的专家们的都没有谈论tNGS呢？甚至有一位会议主持专家明确地表示，不认可tNGS，认为技术所限会影响其在临床的应用。
个人之见可能有以下的原因：一是tNGS在临床应用的时间还比较短，还没有足够的数据可以开展专题讨论；二是这类国内头部医院可能并不是tNGS的主要市场，患者的经济条件好，医生的专业水平高，他们更倾向于使用mNGS；三是会议讨论的主题并不是tNGS的应用场景，专家们讨论的案例基本都是疑难感染，这正是mNGS的用武之地，但并不适合tNGS。
看看厂家，再看看专家，可能病原NGS的星辰大海终将会是mNGS，但在通往未来的路上遍布暗礁，更易于自动化IVD化的tNGS可能是必经的快速通道。
这次的检验年会，有种奇妙的时光错乱感。可以同时看到3年前的事物比如厂家还没迭代的旧产品、专家3年前的PPT，当下的流行产品比如流水线等高端全自动设备、智慧实验室，3年后可能会更好的新物种比如NGS自动化设备、核酸质谱、LDT化的mNGS/tNGS。
如果有时光机，笔者很想去到3年后的检验年会，看看那时的tNGS会是怎样的光景。是已经成为聚光灯下的明星？还是风光散尽已无姓名？
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发表于 2023-4-10 17:24:55